Бактериальный дисбиоз кишечника связан с частотой многих заболеваний, таких как колоректальный рак, воспалительные заболевания кожи и хроническая болезнь почек. Для изучения здоровья кишечника путем измерения микробного разнообразия и численности было разработано несколько индексов, таких как индекс Шеннона, индекс Симпсона, индекс здоровья микробиома кишечника (GMHI) и Faith’s PD.
Несколько исследований показали, что окружающая среда и образ жизни человека значительно влияют на микробиоту кишечника. Интересно, что было отмечено, что у детей, контактирующих с домашними животными, изменено количество таксонов кишечной микробиоты, а у детей, контактирующих с домашней пылью и почвой, наблюдается повышенное разнообразие кишечных микробов. У людей, проживающих вблизи зеленых зон, повышено α-разнообразие кишечника человека. Напротив, те, кто живет в районах с высоким уровнем загрязнения воздуха, подвергаются высокому риску кишечного микробного дисбиоза, который влияет на метаболическое здоровье.
«Предыдущие исследования показали связь между микробиомом в помещении и микробными метаболитами с хроническими заболеваниями (например, ринитом, астмой, синдромом наращивания мышечной массы и дерматитом). Распространенная внутри помещений микробиота, такая как Collinsella, Aspergillus subversicolor и Cutibacterium, связана с частотой многих хронических заболеваний. Однако не все микробы в помещении оказывают негативное воздействие. Например, присутствие в помещении Lactobacillus iners, Prevotella и Dolosigranulum отрицательно связано с частотой возникновения ринита. Кроме того, некоторые внутренние микробиомы (например, Clostridium difficile) также влияют на микробиоту кишечника человека», — сообщается в исследовании.
В этом пилотном исследовании оценивалось влияние микробиома и метаболитов в помещении на микробиоту кишечника человека. В этом исследовании приняли участие 56 детей в возрасте от 3 до 10 лет. Для сбора информации о состоянии здоровья и соответствующих характеристиках окружающей среды использовались электронные вопросники. Для оценки ежегодных загрязнений наружного воздуха использовался метод, взвешенный по расстоянию.
У участников были взяты образцы кала, а пробы пыли — с помощью стерильного пробоотборника. ДНК была извлечена из образцов пыли и проанализирована с использованием метода метагеномного секвенирования shotgun, не зависящего от культуры. Кроме того, для химического профилирования образцов пыли использовалась жидкостная хроматография-масс-спектрометрия (ЖХ-МС).
Дети, набранные в этом исследовании, были случайным образом отобраны из двенадцати из шестнадцати районов Шанхая, Китай. Исследуемая группа состояла из 38% мальчиков и 62% девочек. Более чем у половины группы были братья и сестры, и примерно у 59% детей в раннем детстве были домашние животные или комнатные растения. Двадцать один ребенок проживал в районе с интенсивным движением. Некоторые дети пошли в детский сад. Около 16% детей в раннем детстве подвергались воздействию табакокурения в окружающей среде.
В общей сложности в образцах кишечника были охарактеризованы 318 бактерий, которые принадлежат к типам Proteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes и Bacteroidetes. Возраст детей и время, когда они пошли в детский сад, оказали значительное влияние на микробный состав кишечника. Кроме того, проживание вблизи интенсивного движения также повлияло на микробный состав кишечника.
Авторы утверждают, что это исследование является первым, в котором изучается связь между микробиомом / метаболитами в помещении и микробиотой кишечника. Это исследование показало, как воздействие микробов в помещении влияет на микробиоту кишечника человека.