Они обнаружили, что генотип TT SNP rs11568820 значительно реже встречался у госпитализированных пациентов с COVID-19, что свидетельствует о его защитной роли против тяжелого заболевания и госпитализации.
В настоящем исследовании приняли участие участники 5-летнего Исфаханского когортного исследования COVID (ICC). Всего в исследование были включены 176 пациентов с COVID-19, в том числе 85 госпитализированных пациентов (средний возраст 59,04 года, 37% мужчин) и 91 не госпитализированный пациент (средний возраст 47,77 года, 44% мужчин).
Подходящие пациенты в возрасте 19 лет и старше с положительными результатами ОТ-ПЦР (сокращение от полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией) были отобраны с использованием удобной выборки из наборов данных провинциальных центров здравоохранения.
Хотя критерии госпитализации были основаны на определениях случаев средней или тяжелой степени, принятых Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ), у госпитализированных пациентов не было симптомов.
Сбор данных проводили интервьюеры центра здравоохранения, обученные составлению вопросников и процедурам измерения. Были собраны демографические, социально-экономические данные и данные об образе жизни.
Были получены истории болезни пациентов, включая неинфекционные заболевания, такие как сердечно-сосудистые заболевания, гипертония, сахарный диабет, хронические респираторные заболевания, хроническая болезнь почек, и истории приема лекарств.
Были взяты образцы крови для выделения дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК). Затем качество ДНК оценивали с использованием нанодропы и агарозного геля с последующим генотипированием полиморфизмов гена VDR с использованием ПЦР с системой устойчивых к амплификации мутаций (ARMS) и секвенирования по Сэнгеру.
Статистический анализ включал использование критерия хи-квадрат, точного критерия Фишера, t-критерия Стьюдента, критерия Манна-Уитни, поправки Бонферрони, отношения шансов (OR) и логистической регрессии.
В госпитализированной группе средний возраст и окружность талии были выше, в то время как уровень физической активности был ниже по сравнению с группой, не находившейся в стационаре. Кроме того, в госпитализированной группе была более низкая частота курильщиков в настоящее время, но более высокие показатели артериальной гипертензии и сахарного диабета по сравнению с не госпитализированной группой.
Среди изученных SNP было обнаружено, что генотип TT rs11568820 встречается значительно реже в госпитализированной группе (3,5%) по сравнению с не госпитализированной группой (17,6%; Р = 0,018).
Статистическая значимость также наблюдалась в рецессивной модели (P = 0,003). Однако не было обнаружено существенных различий в генотипах или частотах аллелей SNP rs7970314 и rs4334089 между двумя группами.
Кроме того, генотип rs11568820 SNP продемонстрировал значительную обратную связь с госпитализацией по COVID-19, даже после поправки на сопутствующие заболевания, такие как ишемическая болезнь сердца, текущее курение и индекс массы тела. В частности, этот генотип был связан со снижением риска госпитализации на 82% (OR 0,18).
И наоборот, не наблюдалось существенной взаимосвязи между генотипами SNP rs7970314 и rs4334089 и госпитализацией при COVID-19. Примечательно, что рецессивная модель rs11568820 показала значительную связь с госпитализацией (OR 0,14), в то время как другие SNP не продемонстрировали значимых ассоциаций.
Ключевым преимуществом исследования является изучение распределения SNP VDR при различной степени тяжести COVID-19, что является менее изученной перспективой в предыдущих исследованиях, в которых основное внимание уделялось уровню витамина D в сыворотке крови и восприимчивости к нему.
Однако исследование ограничено его описательным характером, что препятствует установлению причинно-следственной связи между полиморфизмами VDR и тяжестью COVID-19.
Кроме того, отсутствие измерений уровня витамина D в сыворотке крови и данных об иммунологических факторах ограничивает всестороннюю интерпретацию результатов. Это требует более масштабных и детальных исследований в различных подгруппах пациентов.
В заключение, настоящее исследование идентифицировало генотип TT rs11568820 как защитный фактор против тяжелой формы COVID-19. Тем не менее, подтверждение этих выводов требует более масштабных исследований с учетом различных сопутствующих факторов.
В будущем понимание генетической предрасположенности может улучшить персонализированные подходы к лечению COVID-19.