Эта модель анализирует структуры сахара в образцах и превосходит существующие полуручные методы по скорости и точности обнаружения отклонений.
Гликаны, представляющие собой молекулярные структуры сахара в клетках, могут указывать на наличие рака. Однако их измерение с помощью масс-спектрометрии и последующий анализ требуют значительных усилий и глубоких знаний, что делает процесс длительным и сложным. Лишь немногие специалисты в мире обладают необходимой экспертизой для точного анализа этих структур.
Candycrunch автоматизирует этот сложный процесс. Для обучения модели были использованы данные , в которых содержалось свыше 500 00 примеров различных фрагментаций и связанных с ними структур молекул сахара. Благодаря этому обучению Candycrunch смогла определять структуру сахара в 90% случаев всего за несколько секунд.
«Эта разработка существенно ускорит обнаружение биомаркеров на основе гликанов, что значительно улучшит диагностику и прогнозирование рака», — прокомментировал Дэниел Бохар, доцент кафедры биоинформатики в Гетеборгском университете.