В новом исследовании, опубликованном в Nature Neuroscience, использовались вычислительные инструменты для анализа данных о микробиомах аутичных людей, которые были собраны в ходе 25 различных исследований. Многие исследования микробиома фокусируются на целых популяциях микробов и могут рассматривать микробиом только в один момент времени, что может значительно ограничить их возможности, когда микробиом постоянно меняется. Целью этого исследования было сопоставить данные, которые казались разрозненными, и объединить их общим языком, сказал соавтор исследования Джейми Мортон, доктор философии.
Многие из этих исследований оценивали такие вещи, как экспрессия генов, функция иммунной системы и питание у пациентов с РАС и нейротипичных индивидуумов. Используемый алгоритм выявил идеально подобранные пары аутичных и нейротипичных людей в зависимости от возраста и пола, что часто приводит к путанице в исследованиях аутизма. Эта работа выявила микробную сигнатуру, которая может отличать людей с аутизмом от нейротипичных индивидуумов.
“Вместо того, чтобы сравнивать средние результаты по когортам в рамках исследований, мы рассматривали каждую пару как единую точку данных и, таким образом, смогли одновременно проанализировать более 600 пар, контролирующих РАС, что соответствует фактической когорте из более чем 1200 детей”, – объяснил соавтор исследования Гаспар Тарончер-Ольденбург, директор терапевтических альянсов Нью-Йоркского университета.
Ученые обнаружили, что содержание определенных кишечных микробов отличается у нейротипичных людей по сравнению с теми, у кого РАС. Были также метаболические пути, связанные с определенными микробами, которые были активны только у людей с аутизмом. Эти пути были активны у аутичных людей и влияли на такие вещи, как профили экспрессии генов в мозге.
Полученные результаты также согласуются с недавним исследованием, в котором пациентов с аутизмом лечили терапевтическими препаратами, направленными на микробиом, и наблюдали за ними в течение длительного времени.
“Мы раньше не видели такого четкого совпадения между путями метаболизма кишечных микробов и человека при аутизме”, – сказал Мортон.
Это исследование подчеркнуло важность долгосрочных, тщательных исследований, которые оценивают “как можно больше наборов данных” и то, как все меняется при применении терапевтических средств. Длительные исследования, включающие вмешательства, также могут больше рассказать нам о причинно-следственных связях, отметил Мортон.
Подход, использованный в этом исследовании, также может быть использован в других исследованиях, предположили авторы. Это может помочь ученым расшифровать потенциальные связи между микробиомом и многими расстройствами, такими как депрессия, рак или болезнь Паркинсона, сказал соавтор исследования Роб Найт, директор Центра инноваций в области микробиома при Калифорнийском университете в Сан-Диего.